요즘 방학이라 학생들에게 기본적인 실험을 가르치기 위해서 예전에 사용했던 온라인 프로그램들을 다시 둘러보고 있습니다. 그 중에서 DNA 염기서열을 바꿔주는 가장 기본적인 프로그램을 하나 소개합니다. 보통 프라이머 디자인 할 때 reverse 프라이머의 경우 기존 서열의 inverse complement를 이용해서 많이 디자인합니다.

http://arbl.cvmbs.colostate.edu/molkit/manip/index.html 

사용방법은 아래 그림에서 보시는 바와 같이 아주 간단합니다. 위의 공란에 DNA 서열을 copy and paste 하거나 타이핑한 후에 4가지 버튼 (inverse complement, inverse, complement, double-stranded) 중 하나를 누르면 거기에 맞도록 sequence를 바꾸어 줍니다. inverse complement란 상보적인 가닥의 역순을 말하고 inverse는 그냥 역순, complement는 상보적 가닥, double-stranded는 두가닥 서열을 모두 나타내주는 것을 뜻합니다. 잘 모르시겠다면 Get Demo 버튼을 누르셔서 데모서열을 얻으시고 버튼을 한 번씩 눌러보세요.  

위 그림의 순서만 따르면 간단하게 사용가능합니다.


Posted by 바이오매니아